Buenas, el chkdsk es el scandisk de Winxp o lo que es lo mismo, un chequeo y reparación de disco duro de los güindoses.
Pero se supone que te sale por que detecta algún error en el disco o por que se ha apagado malamente el equipo.
De todas formas, si lo dejas que termine, y corrige los errores no debería de volver a salir.
Prueba a ejecutarlo cuando entres en sistema: incicio->ejecutar t el cuadro que te sale, pones chkdsk, y lo dejas que termine. A ver si así solucionamos algo....
Un saludo.