Bueno, empecemos por lo básico.
Los links que te he puesto son para montar servidores, y el programa que te refieres es un cliente que se conecta a un servidor para enviar/recibir correo sobre los servidores.
Para el correo básico hay que montar 2 servidores el SMTP (sendmail, postfix...) para enviar y el POP3 (qpopper ...) para almacenar el correo entrante hasta que el usuario se lo descarga con su programa (ej Thunderbird o Kmail). Y es este último programa el que se encarga de conectarse con los servidores para gestionar el correo, pero que solo hacen eso, gestionar, y necesitan de servidores para enviar y recibir
Por tu primera pregunta, tu necesitas configurar el servidor. ¿es así?