Hola, en mi caso yo tengo un Powerbook y el externo, y siempre lo expulso y después lo apago.
Esto es recomendable que lo hagas asi, porque si no es posible el dia menos pensado tu disco duro se rompa, debido a que cuando tu expulsas cualquier dispositivo este entra en estado reposo, o un estado digamos recomendable para ser apagado. Si apagas de golpe y porrazo lo que estas haciendo es darle pequeñas sobrecargas. Ejemplo: El radiocd de un coche, si tu arrancas el coche con tu radiocd encendido le estas metiendo una pequeña sobrecarga, y si apagas el motor con el radiocd encendido también.
Espero haberte sido de ayuda.
Saludos