La búsqueda automática de archivos compartidos, se refiere a la búsqueda automática de carpetas de red e impresoras, no a los P2P, sino usas esa funcion no hay problema.
Universal Plug & Play permite el intercambio de información y datos a los dispositivos conectados a una red, por ejemplo si queremos actualizar un driver o instalar un nuevo dispositivo y usamos esa funcion, windows buscara en la red, los drivers necesarios si los hay. (Te digo lo mismo, si no la usas, no hay problema)
Las autorizaciones administrativas permiten el acceso a todas las unidades del pc y aunque no esten visibles en un entorno de red se puede tener acceso a ellas, si tu sistema, no comparte red con otros ordenadores, no hay problema, tenerlo activado o desactivarlo.
Un Saludo
PD: Recuerda que todo lo que modifiques con Tune Up se puede deshacer sin problema.