A ver si entendí, primero que nada, lo mejor es que tengas particionado tu DD en por lo menos dos particiones, en la principal o activa, pones solamente El SO, Drivers y Programas y la segunda partición pones el resto de los archivos, como ser documentos, musica, películas, etc. Los archivos de esta segunda partición lo puedes respaldar sin mayores trámites con por ejemplo el Nero, ahora para respaldar la partición activa o principal, necesitaras de programas como el Norton Ghost, el Acronis True Imague o el Drive Imave, el respaldo de esta particion la puedes realizar en CDs, DVDs o hacerla en la segunda partición. Como dato ilustrativo, el otro día reinstalé la imagen del sistema por que se me metió un virus(no uso antivirus) y el trámite me llevó unos 30 minutos.
Obviamente, también puedes hacer respaldo completo de tu DD usando esos programas ya sea en otro DD o en CDS o DVDs.