Hola, yo no sé si es normal que tengas la movida en 2000 ya que lo normal es que venga en 20.000. 20000 milisegundos que son 20 segundos, el tiempo que tarda en apagarse el sistema.
Evidentemente y en cualquier caso debes poner un valor inferior al que tienes.
Sólo se me ocurre que sea enla otra cadena del registro en la que puedas encontrar la misma entrada:
HKEY_CURRENT_USER\Control Panel\Desktop y comprobar el valor que te pone para la clave WaitToKillAppTimeout y de paso modificarlo a 4000 si procede.
Prueba, ya por curiosidad con 4000 independientemente de que te marque 2000 y me lo cuentas

tengo una curiosidad total.
Saludos.
Mabel.