Holas de nuevo,
Perdonad por no contestar ayer, estuve todo el día de parranda, jejeje. (Qué dolor de cabeza me dió la capital y sus atascos... :P)
Bueno, al tema.
No entiendo porqué falla el NOD32 en la MBR de la partición. Si el scandisk no te dio problemas, eso es que está bien, al menos para XP. Quizás es problema de NOD32 que no entenderá algo de la partición.
¿Sabes si hicieron las particiones con el Partition Magic? Si te lo dejaron instalado, quizás puedas verificarlas.
¿Que tipos de archivos es la particion? (Supongo que NTFS)
(Puedes ver el tipo de archivos abriendo MiPC y seleccionando la unidad que quieres ver, en el desplegable de la izq. "detalles" te informará del tipo)
Si la partición el NTFS, puedes, desde una ventana de DOS (INICIO \ TODOS LOS PROGRAMAS \ ACCESORIOS \ SÍMBOLO DEL SISTEMA), vas a la unidad en cuestión, tecleando K: <intro> (imagino que esto ya lo conoces...

) y ejecutas FIXMBR <intro>.
Esto debería reparar la MBR si es que algo estuviera mal para XP, si NOD32 sigue dando el mismo fallo, creo que el problema lo tiene el NOD32.
En cualquier caso, no te detecta virus, y eso ya es algo bueno. ¿Que fecha de actualización de virus tiene el NOD?
Suerte amigo!