Bueno, vamos a ver, tu has creado bien el documento o al menos eso deduzco de tu explicación: en Photoshop tienes que crearte un documento del tamaño que quieras imprimir, yo te recomiendo que por lo menos tu documento sea de 200 ppp (aunque lo normal sea 300 ppp) y al tamaño 12x12 cm, no te fies nunca de las opciones tamaño de impresión y pixeles reales, estas son orientativas, lo que si puedes hacer es; con la regla delante de la pantalla alejar o acercar tu el zoom del documento.
Bueno dicho esto te ha podido pasar lo siguiente, que cuando has mandado imprimir tu documento, activaras la opción ajustarse al papel, y entonces haya encogido, o le hayas dado sin querer a remuestrear la imagen, compruebalo otra vez y ya nos contaras.
Espero haberte sido de ayuda
Saludos