Imagino que el chequeo de puertos que comentas será la típica utitidad de scaneo de puertos, los scan de puertos lo que hacen es chequear que puertos están abiertos y que puertos están cerrados; en principio todos los puertos deben de estar cerrados y solo deben abrirse aquellos que sean requeridos por una aplicación para su correcto funcionamiento, abriéndose generalmente
sólo para esa aplicación, las famosas reglas de configuración.
En principio deberías de crear reglas que permitan conectarse a los programas que necesites, emule, msn, etc en ambos sitios (Kav y Kerio) y con eso debería funcionar, si no lo hace quizás sería mejor que quitases uno de los dos y lo sustituyeses por otro programa que no te cree este tipo de conflictos.
Piensa que no todo el mundo usa el Kav o el Kerio como para encima usar los dos, las probabilidades son pequeñas; personalmente no uso ninguno de los dos por eso no puedo darte una respuesta más concreta
