¿No funcionan ambas conectadas al mismo conector ide??
Las placas traen 2 conectores IDE: el conector 0 y el conector 1
El conector 0 es el primario y tienes opciòn a conectar 2 discos o un disco y una lectora el primero como master y el otro como esclavo, igualmente en el IDE 1 tienes un master y un esclavo, el disco master es el que va a utilizar la particiòn primaria es decir el disco que va a bootear y es recomendable colocarlo en el IDE 0
Lo que generalmente yo hago es conectar los discos en el IDE 0 y las lectoras en el IDE 1, pero para que funcionen las dos lectoras en el mismo cable hay que configurar los jumpers de las lectoras uno como master y la otra como esclavo, sino entraran en conflicto y podria funcionar solo una o no funcionar ninguna.
La configuraciòn de master y esclavo que se hace en los jumpers viene impresa en la carcasa de las lectoras y de los discos
Un saludo