Si al abrir una página puedes ver las animaciones flash, es indicativo que tienes instalado el plug-in, de todas maneras es conveniete matenerlo actualizado y creo que hoy anda por la versión 8.0
Para ver un archivo .swf, lo que debes hacer es pulsar con el botón secundario del mouse en el archivo y allí elegir del menú contextual la opción "abrir con", de la lista resultante debes seleccionar "iesplorer" y además tildar el casillero inferior que hace referencia a recordar la asociación del archivo a la aplicación, de esta manera en el futuro para ver un .swf, bastará hacer doble click