Antes de particionar hay que hacer una planificación del uso del sistema , hay que hacer redireccionamientos de carpetas a otras particiones para que de esta manera el espacio destinado a la partición del sistema sea del menor tamaño posible y esto trae como beneficio el de poder realizar tareas de mantenimiento con mayor rapidez , como sería el caso de desfragmentar, tarea que requiere ser ejecutada con relativa frecuencia para mantener ágil el sistema.
Si usas Xp, sugiero destinar 15 gigas a la partición del sistema, tener otra partición de también unos 15 gigas para guardar allí documentos de uso frecuente y el resto del espacio con otra partición destinada a almacén de archivos en donde tendrán poco movimiento y por lo tanto menos posibilidad de fragmentación tendrán.
Sugiero además crear en el escritorio accesos directos a las particiones y además instalar un catalogador de volúmenes como por ejemplo el "Cathy" gratuito y muy bueno que permite gestionar desde un solo lugar todas las particiones y además todos tus medios de alacenamientos (CDs/DVDs, etc), previo catalogado de los mismos.