No se lo que ocupara Windows, pero para Linux con 3 gigas tienes de sobra (para una instalacion CON TODO).
Para configurarlo no necesitas mucho tiempo. Configurar la red, arrancar el firefox y ya... mas o menos. Pero si nunca has tocado linux te llevará algo más de tiempo la parte de la instalación y aprender como va todo (aunque en las distribuciones que hacen ahora es todo muy intuitivo)
Linux y Windows se instalan en particiones separadas. Es decir, como si dentro del disco duro hubiera dos discos separados y la informacion no puede pasar de uno a otro sin que tu lo autorices. Otra cosa distinta es que te bajes un fichero en linux, lo guardes en un disco y luego lo pases a Windows. En ese caso, si el fichero lleva virus... confia en tu antivirus de windows.