Si te interesa reponer el FF exactamente a como lo tienes ahora, con marcadores, extensiones, contraseñas, etc, etc, un buen método es respaldar las carpetas "Mozilla" (normalmente está en C\\Documents and Settings\Usuario\Datos de programa) y la carpeta "Mozilla Firefox" (suele estar en C\Archivos de Programas), algunos opinan que no resulta necesario respaldar esta última carpeta, pero personalmente opino que si es necesario o al menos es conveniente hacerlo.
Muy importane, luego que tengas a nuevo tu sistema y después de reinstalar el FF, debes "Reemplazar " las carpetas indicadas, o sea primero borra las que tienes y en su lugar colocas la que respaldaste, no cometas el error de "Sobreescribir" las carpetas , por que el resultadso puede ser desastrosos.