Se trata de una prueba. Según comentas, antes, el ordenador se apagaba correctamente, y el problema viene desde que instalaste algún programa.
Cuando apagas windows, se envía un mensaje a todas las aplicaciones, de forma que se les da la oportunidad de terminar de forma ordenada (grabando la información que tengan en memoria, configuraciones, etc). Pues bien, si alguna aplicación no responde correctamente a ese mensaje, puede que windows no sea capaz de cerrarse, ya que se queda esperando la respuesta de la aplicación.
Lo normal, como ocurre en linux, es que se envíe el mensaje (en este caso una señal), y si la aplicación "no quiere cerrarse", el núcleo la detiene sin más. Luego se apaga. En windows, "lo normal" no es siempre lo que ocurre.
Por eso, debes probar cerrando tú las aplicaciones. Puedes comenzar por el antivirus (los antivirus pueden dar problemas de este tipo), y si no se apaga, vuelves a probar, cerrando esta vez otra aplicación. Así podrás determinar qué aplicación es la que no permite cerrar el sistema.
Si antes se apagaba correctamente, no creo que sea problema de APM, aunque se podría haber desconfigurado el sistema.
un saludo.