La ID baja es producida por una mala conexión al servidor, si los puertos no están abiertos en el router o bloqueados por el firewall te sale ID Baja.
La otra única opción que hay para una mala conexión es que tengas los dos ordenadores conectados a la vez y tengan la misma IP de salida, pero eso conllevaría expulsión y posiblemente baneo por parte del servidor, en principio nada que ver con la ID Baja.
Si quieres instalar una versión más nueva en otra carpeta puedes hacerlo, así pruebas si fuese cosa de la versión sin necesidad de desinstalar la que ya tienes, simplemente elige un directorio diferente para instalar el programa y luego copia los archivos importantes del Emule viejo en el nuevo:
De la carpeta Config:
cryptkey.dat
server.met
clients.met
preferences.dat
preferences.ini
staticservers.dat
adresses.dat
server.met
emfriends.met
Y la carpeta TEMP entera.
