Comprueba en primer lugar, de acuerdo con
éste link, que tu memoria virtual está dentro de los valores recomendados.
Acto seguido, indícanos datos de cómo tienes configurado el eMule. Probablemente, tengas:
1) o bien tasas muy altas de bajada y/o subida y tu ordenador no da para más
2) tengas demasiadas conexiones abiertas en tu emule. Comprueba este punto bajo las opciones (o preferencias) del programa, en el apartado conexión. Dinos los valores que aparecen ahí.
3) estás subiendo/bajando demasiados archivos y haces que tu disco y tu ordenador no den a basto con tanta lectura/escritura
A fin de cuentas, la memoria virtual, no es más que el sustituto de tu RAM, cuando ésta "se acaba". Me explico? Destroyer lo explica muy bien en el link (y anterior post publicado simultáneamente...

)
Saludos. Quedamos a la espera.