Muy buenas Chico:
Por lo que veo creo tienes un problema en el sector 0 del disco. Esa utilidad, tarda, pero no tanto. La verdad es que tiene mala pinta, y al precio que están hoy los discos duros... yo me compraría uno, no obstante si no recuerdo mal la manera de areglar ese problema, era crear las particiones desde un disco de linux o un partition magic que te permiten seleccionar el sector de comienzo y de fín. Pero si quieres que todo valla bien, debes instalar el lilo both (pregunta en la seccion linux) si quieres que ese disco sea de arranque.
Saludos