Lo que comentas me parece bastante raro, y aunque creo qeu te puedo ayudar poco asegurate de estas cosas antes de seguir pensando.
.-Comprueba primero con algun test de velocidad qeu no es un problema del servicio.
.-Comprueba en el registro del emule cuando te pase eso que no te estan baneando (no creo pero por si acaso) o que no tienes algun mensaje referido al Black List no vayas a tener un mod demasiado agresivo.
.-Supongo que estaremos hablando de 10-15 archivos en descarga y que no eres un flipao de esos de 40 archivos en descarga con 600 fuentes y mil conexiones. Si tienes algo de eso, cortate un pelo y pon una configuracion light al menos para comprobar si te hace eso o no.
.-Comprueba tambien que en opciones adicionales, no tienes un numero de conexiones maximas cada 5 segundos mayor de 28 o asi para comprobarlo.
.-Asegurate de tener cambiados los puertos del emule (tcp/udp) a otros, ya que algunos servidores de adsl estan desviando a lineas embudo a usuarios que utilizan esos puertos, a lo mejor alguna empresa de cable ha empezado a hacerlo.
.- No tendras algun programa que use ancho de banda cada poco tiempo buscando actualizaciones o algo asi y te estreche tu linea.
.- Si a estas alturas nada de lo de antes lo tienes mal, descargate otra version del emule e instalala en un sitio diferente sin borrar el anterior y comprueba si te lo hace o no.
Y, bueno, por ahora no se me ocurre nada mas, pero informanos del tema y seguimos pensando.
Saludos!!!