Si el pendrive se quemó o se cruzó, creo que será muy dificil por no decir casi imposible recuperar la información, la razón es simple un HD tiene una parte electronica que maneja el disco y los platos en los cuales tienes la información, si se quema el HD puedes cambiar la tarjeta logica o sea la parte electronica y recuperas el disco completo, si se dañan los platos se perdio el disco aunque no se haya quemado la logica.
En el pendrive todo es electronico, si se quema se tira al tacho
Al margen de ello los tecnicos en discos tienen programas especiales para recuperación de data y se dedican a ello porque el precio de un disco y el tamaño justifican el esfuerzo, los pendrive tienen un precio bastante bajo y se considera de uso transitorio, y los técnicos asumen que es mas facil y rentable desechar y reemplazar por uno nuevo.
Lamento no darte buenas noticias