Hola. Creo que yo tuve un problema parecido, pero fué hace tanto tiempo que no recuerdo como lo solucioné (también recuerdo que no me iba bien la ñ).
Recuerdo que a mi me pasó en Win98. Si usas Win 98, en el autoexec.bat tendrías que tener esta línea keyb sp,, (+ una ruta que no recuerdo bien...). El caso es que para el teclado español de España, tiene que ser keyb sp,,
Si no es lo de arriba, mientras esperas a que alguien te de alguna solución mejor puedes usar la arroba --> manteniendo pulsada la tecla ALT y tecleando 64 en el teclado numérico.
Un saludo.