Igual de seguro mmm creo q si. Por ej en el Bitcomet puedes introducir en la carpeta Rules los filtros para bloquear un rango de IPs no deseadas. Es lo mismo q los programas P2PFire, P2PHazard, etc.
Lo malo puede ser q no encontraras tantas cosas como en el emule, y q si estan poco compartido puede q nunca llegues a completarlo. Lo bueno es q tienes la posibilidad de si te quedas a media seguir con el emule, siempre y cuando exista esa misma descarga con el mismo tamaño.
Pruebalo a ver q te parece.