Generalmente son los ventiladores, no suele haber muchos, el de la fuente de alimentación suele ser el más ruidoso cuando se estropea, luego suelen estar el del microprocesador y si acaso en la tarjeta gráfica, aunque este último no lo tienen todas, ya tiene que ser buena la jodía.
Si fuese el de la fuente de alimentación ya te digo de antemano que comprar una fuente de alimentación nueva te va a salir casi que mejor, yo en su momento no encontré el ventilador por separado y compré una nueva más potente y silenciosa que no me costó mucho. El ventilador del micro es un poco más engorroso, hay que sacarlo, limpiar bien la zona, ponerle una masilla especial y colocar el ventilador nuevo; no es complicado pero hay que prestar atención al tema.
Yo mismo en la última limpieza que hice del equipo lo desmonté todo, fuente de alimentación, ventilador del micro, etc y como digo es solo cuestión de ir cuidado tanto al desmontar como al montar, cualquiera puede hacerlo (seguro porque soy un poco torpe con tendencia a romperlo todo).
Bueno, la cosa pasaría por abrir el cacharro y ver si las palas de los ventiladores están dañadas, si lo están habría que cambiarlos, si no lo están igual es un problema de suciedad.